如果一个公司被其员工投诉到了劳动局的话，该公司会接受劳动局相关部门的检查，如果劳动局相关部门检查了以后，证实了员工所说的事件是属实的，那么劳动局就会给这个公司相应的处罚。根据《劳动保障监察条例》，劳动监察大队如果在劳资争议纠纷中发现企业存在某些不当行为时，可以对企业进行相关罚款处罚。劳动保障局的处罚就是三种：一是改正错误，比如欠薪企业照发工资;二是企业拒绝劳动保障局的处罚，劳动保障局会与工商局配合吊销企业营业执照;三是政府部门对企业负责人的处罚，一般是罚款。
并且，可能会由于这个事件而影响了公司的形象，从而导致了公司的收益下降等等。因此我们建议当员工与公司发生了矛盾的时候，可以进行私下解决，这样公司所受到的影响会更小一些。
法律依据：
《劳动保障监察条例》第九条任何组织或者个人对违反劳动保障法律、法规或者规章的行为，有权向劳动保障行政部门举报。
劳动者认为用人单位侵犯其劳动保障合法权益的，有权向劳动保障行政部门投诉。
劳动保障行政部门应当为举报人保密；对举报属实，为查处重大违反劳动保障法律、法规或者规章的行为提供主要线索和证据的举报人，给予奖励。
第十七条
劳动保障行政部门对违反劳动保障法律、法规或者规章的行为的调查，应当自立案之日起60个工作日内完成；对情况复杂的，经劳动保障行政部门负责人批准，可以延长30个工作日。
第十八条
劳动保障行政部门对违反劳动保障法律、法规或者规章的行为，根据调查、检查的结果，作出以下处理：
（一）对依法应当受到行政处罚的，依法作出行政处罚决定；
（二）对应当改正未改正的，依法责令改正或者作出相应的行政处理决定；
（三）对情节轻微且已改正的，撤销立案。
发现违法案件不属于劳动保障监察事项的，应当及时移送有关部门处理；涉嫌犯罪的，应当依法移送司法机关。