一般是在过户的时候付首付。
要是你贷款买一手房的话，一般给了首付之后，得等到还完款了，你才可以拿到房产证。但是二手房按揭贷款就不一样了，本身二手房屋主就已经实际拿到了房产证，所以，通常这个时候是考虑什么时候过户。
其实，你要是按揭贷款购买二手房，对于是要先付首付签合同，还是在过户时再付首付，完全由你们买卖双方自主决定的，但也需要考虑银行方面的。
因此，按揭贷款购买二手房时，通常你要走的流程：
1、你们要先先签合同，约定采用按揭付款的方式；
不过在确定之前，你首先要明确你究竟符不符合能够申请二手房贷款的条件。实际中，二手房屋贷款申请需要具备以下主要条件：
(1) 你是年满18年周岁的具有完全民事行为能力、城镇居民常住户口或合法有效的居留身份证明。
(2)你要有稳定合法收入，有还款付息能力。
(3)你要同意以所购房屋及其权益作为抵押物。
(4)准备购买的二手房的产权明晰，符合可进入房地产市场流通的条件。
(5)所购的房屋不在拆迁公告范围内。
2、你就要着手付首付或按银行要求将首期款放到银行监管，同时向银行申请按揭贷款；
3、等贷款获批后，就可以去办理过户手续；
4、在出买家产权证后，银行将监管的首期款支付给卖方(如银行约定必须如此操作首付)；
5、在你将新证抵押给银行后，银行就会放按揭款给卖方了。
法律依据:
《物权法》：
第十五条　当事人之间订立有关设立、变更、转让和消灭不动产物权的合同，除法律另有规定或者合同另有约定外，自合同成立时生效；未办理物权登记的，不影响合同效力。
《房屋登记办法》;
第三十五条
因人民法院或者仲裁委员会生效的法律文书、合法建造房屋、继承或者受遗赠取得房屋所有权，权利人转让该房屋所有权或者以该房屋设定抵押权时，应当将房屋登记到权利人名下后，再办理房屋所有权转移登记或者房屋抵押权设立登记。
因人民法院或者仲裁委员会生效的法律文书取得房屋所有权，人民法院协助执行通知书要求房屋登记机构予以登记的，房屋登记机构应当予以办理。房屋登记机构予以登记的，应当在房屋登记簿上记载基于人民法院或者仲裁委员会生效的法律文书予以登记的事实。