员工请假的扣除工资的方法：
1、事假。,按规定，事假一天扣工资数额=月薪÷21.75。21.75为劳动法规定的月计薪天数。月计薪天数=(365天-104天)÷12月=21.75天
2、病假。按规定，病假一天扣工资数额=月薪÷21.75X40%，其中40%为最大扣款比例，一般公司扣款比例低于40%，且部分公司设有一定天数的带薪病假。
法律依据：
根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》(劳部发[1994]479号)等有关规定，任何企业职工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，企业应该根据职工本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予一定的医疗期。