契税滞纳金的缴纳时间从滞纳税款的那一天开始计算。滞纳金的计算也有一定的法律规定，按照法律的规定滞纳金的征税金额为税款的万分之五，一般情况下，只有缴纳完契税才可以领取房产证。
法律依据:
《国家税务总局关于农业税、牧业税、耕地占用税、契税征收管理暂参照<中华人民共和国税收征收管理法>执行的通知》
二、关于加收农业税收税款滞纳金问题。凡税款滞纳行为发生在2001年4月30日以前的，按照原《税收征管法》规定，按日加收滞纳税款千分之二的滞纳金；2001年5月1日以后发生的，统一按照《税收征管法》规定，按日加收滞纳税款万分之五的滞纳金。
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