分居两年办理离婚有两种方式。协议离婚：双方就财产分割、子女抚养等问题协商一致后，签订离婚协议书，共同到婚姻登记机关申请离婚登记。经过冷静期（30 天）后，双方再共同到婚姻登记机关申请发给离婚证。诉讼离婚：一方向法院提起离婚诉讼。因感情不和分居满两年是认定夫妻感情破裂的情形之一，法院审理后若认为夫妻感情确已破裂，会判决准予离婚。原告需提交起诉状、结婚证、身份证等材料，陈述夫妻感情破裂的事实及理由。法院受理后会安排调解，调解不成则依法判决。无论选择哪种方式，都要妥善处理好财产分割和子女抚养等问题，以保障自身合法权益。
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