员工请假工资扣两倍不合法。工资是劳动者付出劳动后应得的报酬,用人单位应按照劳动合同约定和国家规定及时足额支付。请假属于员工因合理事由暂时无法提供劳动的情况,用人单位不能随意克扣工资,更不能以扣两倍工资的方式处理。根据相关规定,用人单位不得克扣劳动者工资。有下列情况之一的,用人单位可以代扣劳动者工资:(一)用人单位代扣代缴的个人所得税;(二)用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用;(三)法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费;(四)法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。除此之外,其他形式的扣工资行为都是违法的。如果员工遇到用人单位违法扣工资的情况,可以与用人单位协商解决,要求其按照规定支付工资;协商不成的,可以向劳动监察部门投诉,由劳动监察部门责令用人单位限期支付;逾期不支付的,责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金;也可以依法申请劳动仲裁,通过法律途径维护自己的合法权益。
以上是律师的法律建议,如有疑问,欢迎进一步咨询。