小产权房纠纷当然是可以打官司的。今日所称打官司或诉讼，是我国是指公安机关、人民检察院、人民法院和当事人以及有关的人依照法律为解决被告人的刑事责任问题或解决权利义务纠纷、明确权利义务关系的一切活动。
由于“小产权房”买卖合同方面具有法律法规并不明确，现阶段各地法院对于有关买卖案件的处理也不尽相同。根据现行土地管理法法律、政策的规定，应当认定“小产权房”买卖合同无效，但出卖人明知其出卖的房屋及宅基地属禁止流通的范围，在出卖多年后又以违法出售房屋为由主张合同无效，应当赔偿买受人利益损失。
目前，全国大多数高级人民法院有明确的意见：农村私有房屋买卖合同的效力应认定无效为原则，以认定有效为例外。只有房屋买卖的双方均是同一集体经济组织的成员的，可以认定该买卖合同有效。
法律依据：
《最高院农村私有房屋买卖纠纷合同效力认定及处理原则研讨会会议纪要》全文