虽然非法行医罪和医疗事故罪都与疾病的诊疗活动有关，但二者的区别是显著的，主要表现在以下方面：
1、主体不同
非法行医罪的主体是没有取得医生从业资格的人。而医疗事故罪的主体，则是合法执业的医护人员。
2、行为不同
非法行医行为是不符合法律规定的。医疗事故罪的诊疗活动，是依法进行的。
3、结果不同
非法行医只需要“情节严重”即可构成犯罪，而医疗事故罪的成立，需要达到“严重不负责任、造成就诊人员死亡或者严重损害其身体健康”的程度;
4、主观过错内容不同
非法行医罪主观过错为故意，医疗事故罪的主观过错为重大过失。
5、法定刑不同
非法行医罪法定刑分为两档，最高刑可达10年。医疗事故罪法定刑只有一档，并且最高刑只有3年。
法律依据：
《中华人民共和国刑法》第三百三十六条
【非法行医罪】未取得医生执业资格的人非法行医，情节严重的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金;严重损害就诊人身体健康的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金;造成就诊人死亡的，处十年以上有期徒刑，并处罚金。
《中华人民共和国刑法》第三百三十五条
【医疗事故罪】医务人员由于严重不负责任，造成就诊人死亡或者严重损害就诊人身体健康的，处三年以下有期徒刑或者拘役。