发生土地纠纷后调解可参照如下程序进行：
一、当事人申请调解的，村组或乡镇农村土地承包调解委员会应当调解;农村土地承包调解员也可以主动调解。
二、调解由1-2名调解员进行。调解员应充分听取当事人的陈述，讲解有关法律法规和国家政策，耐心疏导，引导当事人平等协商、互谅互让，达成调解协议。当事人要求调查取证的，调解员可以进行。
三、调解员应根据当事人达成的协议，依法制作调解协议书。双方当事人和解后要求制作调解协议书的，调解员可以制作。调解协议书由双方当事人签名、盖章或者按指印，经调解人员签名并加盖调解组织印章后生效。调解不成的，调解员应告知当事人可以通过仲裁、诉讼等途径解决纠纷。
四、调解员应当将双方当事人基本情况、争议内容、调查取证、调解情况记录、调解协议书等材料立卷归档。
法律依据：
《中华人民共和国商业经济纠纷调解试行办法》
第六条对商业经济纠纷的调解工作，由调解机构指定调解员主持或组成调解小组主持。
调解员和调解小组以调解机构的名义开展工作，并定期或不定期地向其主管领导请示汇报工作。
第十条县（市）、市辖区内的商业经济纠纷，当事人双方有共同上级主管部门的，由最直接的共同上级主管部门的调解机构调解；没有共同上级主管部门的，由被申请人一方最直接的上级主管部门或县级主管部门的调解机构调解。
不同县（市）、市辖区的商业经济纠纷，当事人双方有共同上级主管部门的，由最直接的共同上级主管部门的调解机构调解；没有共同上级主管部门的，由被申请人最直接的上级主管部门直至省级主管部门的调解机构调解。
不同省、自治区、直辖市的商业经济纠纷，由被申请人一方最直接的上级主管部门直至省级主管部门的调解机构调解；在全国有重大影响或争议金额在一千万元以上的商业经济纠纷，由商业部调解机构调解。