《刑事诉讼法》第一百八十条规定，对于有被害人的案件，决定不起诉的，人民检察院应当将不起诉决定书送达被害人。被害人如果不服，可以自收到决定书后七日以内向上一级人民检察院申诉，请求提起公诉。人民检察院应当将复查决定告知被害人。对人民检察院维持不起诉决定的，被害人可以向人民法院起诉。被害人也可以不经申诉，直接向人民法院起诉。人民法院受理案件后，人民检察院应当将有关案件材料移送人民法院。
《刑事诉讼法》第二百一十条第三款的规定，“被害人有证据证明对被告人侵犯自己人身、财产权利的行为应当依法追究刑事责任，而公安机关或者人民检察院不予追究被告人刑事责任的案件”，被害人有权提起自诉。
由此可以看出，公诉转自诉案件其实是对公安机关，检察院行为的一种审查，是一种监督纠错机制。它本质上仍是公诉案件，只不过赋予了被害人自诉的救济权利，因此是不允许调解的，除了民事赔偿部分。但是根据相关法律规定，可以进行和解。
法律依据：
《刑事诉讼法》第一百八十条、第二百一十条