依据我国《合同法》的规定，如果企业签订的合同是依法成立的，就算公章盖重叠了，并不影响合同的效力。
如果能够准确地分清两个合同的章的内容就可以认定为合同有效。但是如果两个合同章重叠后导致章印模糊不清，难以认定，这个时候就难以认定合同未有效，此时最好的做法是重新写合同，然后重新盖章。如果不小心出现了这种情况，也难以重新盖章，这个时候，合同当事人可以约定出具一个证明文件来证明这个合同的效力，但为了保险起见可以重新写一份合同，重新对其进行盖章。依法成立的合同，自成立时生效。法律、行政法规规定应当办理批准、登记等手续生效的，依照其规定。《合同法》规定，有下列情形之一的，合同无效：
(一)一方以欺诈、胁迫的手段订立合同，损害国家利益;
(二)恶意串通，损害国家、集体或者第三人利益;
(三)以合法形式掩盖非法目的;
(四)损害社会公共利益;
(五)违反法律、行政法规的强制性规定。
法律依据：
《中华人民共和国合同法》第八条
依法成立的合同，
对当事人具有法律约束力。当事人应当按照约定履行自己的义务，不得擅自变更或者解除合同。依法成立的合同，受法律保护。
法律、行政法规规定应当办理批准、登记等手续生效的，依照其规定。
《中华人民共和国合同法》第五十二条
有下列情形之一的，合同无效：
(一)一方以欺诈、胁迫的手段订立合同，损害国家利益;
(二)恶意串通，损害国家、集体或者第三人利益;
(三)以合法形式掩盖非法目的;
(四)损害社会公共利益;
(五)违反法律、行政法规的强制性规定。