因房地产项目时间比较长，大部分房地产企业是按预收款的一定的比例预交的土地增值税。土地增值税项目清算，就是对符合清算条件的项目进行清算。
1、凡符合下列情况之一的，纳税人应到主管地方税务机关办理土地增值税清算手续：
(1)全部竣工并销售完毕的房地产开发项目。
(2)整体转让未竣工的房地产开发项目。
(3)直接转让土地使用权的项目。
(4)纳税人申请注销税务登记的房地产开发项目。
2、符合下列情况之一的，主管地方税务机关可要求纳税人进行土地增值税清算：
(1) 纳税人开发的房地产开发项目已通过竣工验收，在整个预(销)售的房地产开发建筑面积达到可销售总建筑面积的比例85%(含)以上的。
(2)取得销售(预售)许可证满三年仍未销售完毕的。
(3)经主管地方税务机关进行纳税评估发现问题后，认为需要办理土地增值税清算的房地产开发项目。
(五)对于房地产开发企业建造的商品房，在未出售前先自用或出租使用年限在一年以上的，不再列入土地增值税清算的范围，应按照转让旧房及建筑物的政策规定缴纳土地增值税。
法律依据：
《中国农业银行房地产开发建设贷款管理办法（试行）》第十条、第十一条、第十三条、第二十条规定