《民事诉讼法》第33条规定，因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民法院管辖。所谓不动产纠纷是指因不动产的权利确认、分割、相邻关系等引起的物权纠纷。农村土地承包经营合同纠纷、房屋租赁合同纠纷、建设工程施工合同纠纷、政策性房屋买卖合同纠纷，按照不动产纠纷确定管辖。”
因此，与建设工程施工合同纠纷相关的案件，根据民诉法及相关司法解释的规定，应参照不动产纠纷确定管辖，即由不动产所在地人民法院管辖。这属于民诉法规定的专属管辖，专属管辖是地域管辖的一种。即法律规定某些案件必须由特定的法院管理，当事人不能以协议的方式加以变更。具有强制性和排他性，与特别管辖不完全相同。因此，建设工程施工合同纠纷当事人，只能由不动产所在地即建设工程所在地法院管辖案件，不能约定其他法院管辖。
但专属管辖是针对法院的管辖权而言的，专属管辖不得对抗仲裁，即当事人可以通过仲裁协议选择仲裁机构仲裁解决纠纷。
法律依据
《民事诉讼法》第三十三条
下列案件，由本条规定的人民法院专属管辖:
(一)因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民法院管辖;
(二)因港口作业中发生纠纷提起的诉讼，由港口所在地人民法院管辖;
(三)因继承遗产纠纷提起的诉讼，由被继承人死亡时住所地或者主要遗产所在地人民法院管辖。
《最高人民法院关于适用<中华人民共和国《民事诉讼法》>的解释》第二十八条
《民事诉讼法》第三十三条第一项规定的不动产纠纷是指因不动产的权利确认、分割、相邻关系等引起的物权纠纷。农村土地承包经营合同纠纷、房屋租赁合同纠纷、建设工程施工合同纠纷、政策性房屋买卖合同纠纷，按照不动产纠纷确定管辖。不动产已登记的，以不动产登记簿记载的所在地为不动产所在地；不动产未登记的，以不动产实际所在地为不动产所在地。