小产权房屋买卖合同是不能公证的。小产权房屋在我国是禁止买卖的，任何买卖小产权房屋的行为都是违法行为，公证的目的在于公证房屋买卖行为的合法有效性，对于国家明令禁止的行为是不会进行公证的。
小产权房的分类
1、针对发展商的产权而言，将发展商的产权叫大产权房，购房人的产权叫小产权房，这种叫法是因为购房者的产权是由发展商一个产权分割来的。
2、按房屋再次转让时是否需要缴纳土地出让金来区分的，不用再缴土地出让金的叫大产权，要补缴土地出让金的叫小产权。按这种解释普通商品房就是大产权房，经济适用房就是小产权房。
3、按产权证的发放机关来区分的，国家发产权证的叫大产权，国家不发产权证的，由乡镇政府发证书的叫小产权，又称乡产权，乡产权并不构成真正法律意义上的产权。
第1和第2种分类的小产权是合法的，只要交足了购房款，或转让时补缴土地出让金就可以自由买卖(经济适用房需房屋产权证自发证日起满5年才可上市交易)，其法律规定较为明确。而第3种解释的小产权的法律属性存在的较大争议，而且拿不到真正法律意义上的产权证。
法律依据：
《公证法》
第十三条
公证机构不得有下列行为：（一）为不真实、不合法的事项出具公证书；（二）毁损、篡改公证文书或者公证档案；（三）以诋毁其他公证机构、公证员或者支付回扣、佣金等不正当手段争揽公证业务；（四）泄露在执业活动中知悉的国家秘密、商业秘密或者个人隐私；（五）违反规定的收费标准收取公证费；（六）法律、法规、国务院司法行政部门规定禁止的其他行为。