在房产纠纷中，有的时候会遇到没有确权的房屋或者对房屋的所有权有争议，为了能取得房屋所有权，就需要向有关部门申请房屋确权，那应该向什么机关申请呢?下面由我为您解答。
办理房产初始登记、变更登记、注销登记。申请单位(人)到房屋所在区房管局填写房产登记申请审批书，提供规定的资料进行登记;区房管局对申报资料进行初审,办理各种房屋权属登记，承办初审、复审、审批职责的区房管局、市房产交易所、市房屋产权登记中心，应在5个工作日内完成所承担的办理事项，符合规定条件的，转送复审、审批单位，填制权属证书，不符合规定条件的予以退回。
房屋确权是保障房屋所有人依法对自己的房屋享有占有、使用、收益、和处分的权利，它是唯一完全的物权。同时，也是房地产权属登记、权属变更、转让、评估、抵押、中介服务等的产权、产籍的管理的法定依据。
可以看到房屋的确权一般是由房管局以及房屋产权登记中心进行管理和登记，而需要注意的是，与此相对的土地确权是由当地的土管所来进行登记证明。

法律依据：
《中华人民共和国城市房地产管理法》 第六十条
以出让或者划拨方式取得土地使用权，应当向县级以上地方人民政府土地管理部门申请登记，经县级以上地方人民政府土地管理部门核实，由同级人民政府颁发土地使用权证书。
在依法取得的房地产开发用地上建成房屋的，应当凭土地使用权证书向县级以上地方人民政府房产管理部门申请登记，由县级以上地方人民政府房产管理部门核实并颁发房屋所有权证书。
房地产转让或者变更时，应当向县级以上地方人民政府房产管理部门申请房产变更登记，并凭变更后的房屋所有权证书向同级人民政府土地管理部门申请土地使用权变更登记，经同级人民政府土地管理部门核实，由同级人民政府更换或者更改土地使用权证书。
法律另有规定的，依照有关法律的规定办理。