对事实婚姻关系的处理应遵循以下原则：
(1)事实婚姻关系具有婚姻的效力。凡认定为事实婚姻关系的，实际是确认其为合法有效婚姻关系，双方当事人的关系适用婚姻法中有关夫妻权利义务的规定。
(2)审理事实婚姻案件，当事人撤诉的，确认婚姻关系有效，发给裁定或应判决准予离婚。
(3)事实婚姻关系离婚时，子女的抚养、财产的分割及对生活困难一方的经济帮助等问题。
法律依据：
《婚姻登记管理条例》实施后，未办结婚登记以夫妻名义共同生活的男女，双方符合结婚实质条件的，补办登记后，则产生合法婚姻的效力。未补办结婚登记的，其非法同居关系的处理原则如下：
(1)经查确属非法同居关系的，应一律判决解除。
(2)离婚后，双方未再婚，未履行复婚登记手续，又以夫妻名义同居生活，一方起诉“离婚”的，一般应解除非法同居关系。
(3)人民法院审理非法同居关系的案件，如涉及非婚生子女抚养和财产分割问题，应一并予以解决。