合同变更是否影响抵押合同效力是有争论的，但是大部分的观点是，只要主合同变更不存在违法法律规定的情形的，抵押合同作为从合同依然有效，抵押权的特征之一是其从属性，即抵押权作为一种担保物权，自然属于从权利，其成立、消灭和处理必须以一定债权关系的存在为前提而且从属于该主债权。主合同虽变更，但只要主合同有效，抵押合同亦有效。如主合同或抵押合同有特别约定，按照特别约定办理。
法律依据:
1、《中华人民共和国担保法》第九十条规定：“当事人在定金合同中应当约定交付定金的期限，定金合同从实际交付定金之日起生效。”
2、根据《中华人民共和国合同法》第五十六条规定“合同部分无效，不影响其他部分效力的，其他部分仍然有效。”