施工单位是由相关专业人员组成的、有相应资质、进行生产活动的企事业单位。比如，建设单位自营工程的施工队、房修队、国营建筑公司、安装公司、工程队、市政公司及集体施工企业等组织机构，都可以叫做施工单位。
建设单位是指建筑工程的投资方，对该工程拥有产权。建设单位也称为业主单位或项目业主，指建设工程项目的投资主体或投资者，它也是建设项目管理的主体。主要履行提出建设规划、提供建设用地和建设资金的责任。
施工单位与建设单位的区别在于，建设单位是业主，出钱并监督施工，相当于地主；施工单位是承揽项目，负责施工的，相当于长工。所以也可以形象地说建设单位就是甲方，是出钱盖房子的人。
法律依据:
《中华人民共和国建筑法》
第七条 建筑工程开工前，建设单位应当按照国家有关规定向工程所在地县级以上人民政府建设行政主管部门申请领取施工许可证；但是，国务院建设行政主管部门确定的限额以下的小型工程除外。 按照国务院规定的权限和程序批准开工报告的建筑工程，不再领取施工许可证。
《中华人民共和国建筑法》第三十二条
《中华人民共和国建筑法》第三十一条