工程价款结算应该按照合同约定进行办理。合同未作约定或者约定不明的，应该依照相关规定与文件协商处理。当事人对合同造价有争议无法协商解决的，可以通过向人民法院提起诉讼或者申请仲裁。
《建设工程价款结算暂行办法》第十一条规定：工程价款结算应按合同约定办理，合同未作约定或约定不明的，发、承包双方应依照下列规定与文件协商处理：
（一）国家有关法律、法规和规章制度；
（二）国务院建设行政主管部门、省、自治区、直辖市或有关部门发布的工程造价计价标准、计价办法等有关规定；
（三）建设项目的合同、补充协议、变更签证和现场签证，以及经发、承包人认可的其他有效文件；
（四）其他可依据的材料。
第二十条规定：当事人对工程造价发生合同纠纷时，可通过下列办法解决：
（一）双方协商确定；
（二）按合同条款约定的办法提请调解；
（三）向有关仲裁机构申请仲裁或向人民法院起诉。