关于空地院落的补偿，最高人民法院给山东省高院的答复可以作为一个参考：对土地公有制之前，通过购买房屋方式使用私有的土地，土地转为国有后迄今仍继续使用的，未经确权登记，亦应确定现使用者的国有土地使用权。国有土地上房屋征收补偿中，应将当事人合法享有国有土地使用权的院落、空地面积纳入评估范围，按照征收时的房地产市场价格，一并予以征收补偿，可见，国有土地上房屋征收时，空地院落的国有土地使用权应当按照市场价格评估补偿。而农村集体土地上空地院落属于农村建设用地，因此，在拆迁的时候，按照农村建设用地补偿标准进行补偿，如果空地院落已经用水泥或者石板硬化，则应当按照地上附着物，结合建造成本与使用年限进行评估补偿。
法律依据:
1、《关于征收国有土地上房屋时是否应当对被征收人未经登记的空地和院落予以补偿的答复》明确对于当事人合法享有国有土地使用权的院落、空地面积补偿标准，应按照征收时的房地产市场价格”。

2、《国有土地上房屋征收评估办法》第11条规定，被征收房屋价值是指被征收房屋及其占用范围内的土地使用权在正常交易情况下由熟悉情况的交易双方以公平交易方式在评估时点自愿进行交易的金额。

3、《国有土地上房屋征收与补偿条例》第二十条规定，对于房地产评估机构的选定，应先由被征收人协商选定;协商不成的，通过多数决定、随机选定等方式确定，对于评估结果应当公平合理。