分居三年以上不能自动解除婚姻。婚姻关系的解除有两种方式：协议离婚：双方自愿离婚并签订书面离婚协议，共同到婚姻登记机关申请离婚登记。经过冷静期后，双方再亲自到婚姻登记机关申请发给离婚证。诉讼离婚：夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。因感情不和分居满二年，调解无效的，应准予离婚。这里的分居需是因感情不和，且要能提供相应证据证明。总之，分居三年不是解除婚姻关系的法定情形，需通过法定程序办理离婚手续才能解除婚姻关系。。
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