1.性质不同不予起诉是检察院在审查起诉阶段作出的决定,意味着不将案件移送法院审判,终结刑事诉讼。免于刑事处罚是法院在审判阶段作出的判决,虽然宣告有罪,但不给予刑事处罚。2.适用阶段不同不予起诉适用于审查起诉阶段,由检察院依职权决定。免于刑事处罚适用于审判阶段,由法院作出判决。3.适用条件不同不予起诉的情形包括犯罪嫌疑人没有犯罪事实,或者有《刑事诉讼法》第十六条规定的情形之一等。免于刑事处罚是犯罪情节轻微不需要判处刑罚的,可以免予刑事处罚。4.法律后果不同不予起诉后,被不起诉人如果在押,应当立即释放。免于刑事处罚后,仍会有有罪宣告,只是不执行刑罚。法律依据:《刑事诉讼法》第十六条规定了多种不追究刑事责任的情形;第一百七十七条规定了不起诉的相关情形;第三十七条规定了对于犯罪情节轻微不需要判处刑罚的,可以免予刑事处罚等内容。
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