刑事案件不起诉是否有案底需要分情况来看:1. 法定不起诉:如果是因为情节显著轻微、危害不大不认为是犯罪;犯罪已过追诉时效期限;经特赦令免除刑罚;依照刑法告诉才处理的犯罪没有告诉或者撤回告诉;犯罪嫌疑人、被告人死亡;其他法律规定免予追究刑事责任的这种情况下作出的不起诉决定不会留下案底。因为这类情形本身就不符合犯罪构成要件或不应被追究责任。2. 酌定不起诉:对于犯罪情节轻微依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的人民检察院可以作出不起诉决定。这种情况下虽然没有被法院定罪判刑但仍可能被认为有违法事实存在被记录在案的可能性也就是可能会留下案底。3. 证据不足不起诉:对于二次补充侦查的案件人民检察院仍然认为证据不足不符合起诉条件的应当作出不起诉的决定。这种不起诉并不意味着嫌疑人无罪只是现有证据达不到起诉标准也有可能留下案底。
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