如果夫妻双方通过分居成功离婚，那么孩子又该怎么办呢？
一、在离婚案件中，如果父母双方就子女的抚养问题达成协议的，一般会尊重当事人的意思表示，按其协议进行处理，但协议对子女的正常生活有严重不利的除外。
二、离婚诉讼中孩子的抚养权由人民法院根据子女的权益和双方的具体情况判决。法院通常以有利于孩子健康成长为原则进行判决的，一般来说抚养条件更好的一方，更具有优势，获得孩子抚养权的可能更大。
两周岁以下的子女，一般随女方生活。女方有下列情形之一的，可以随男方生活：
(一)患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，子女不宜与其共同生活的；
(二)有抚养条件不尽抚养义务，而父方要求子女随其生活的；
(三)因其他原因，子女确无法随母方生活的。
两岁以上的孩子，以有利于孩子健康成长为原则，如果由男方抚养更有利于孩子健康成长，则应判随男方生活。八周岁以上的孩子，一般会征求孩子的个人意见。
法律依据：
《婚姻法》
第三十六条父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或母直接抚养，仍是父母双方的子女。
离婚后，父母对于子女仍有抚养和教育的权利和义务。
离婚后，哺乳期内的子女，以随哺乳的母亲抚养为原则。哺乳期后的子女，如双方因抚养问题发生争执不能达成协议时，由人民法院根据子女的权益和双方的具体情况判决。