在建筑施工纠纷中，将有关书证、物证收集完整，如发包方的招标文件、承包方的投标书、承包方、发包方订立的《建设工程承包合同》、工程施工图纸、设计技术交底、图纸会审纪要、工程量签证单、在工程施工过程中对于设计变更的联系单、隐蔽工程的验收记录、工程预决算书等。将不易保存的证据以照片、视听资料等形式固定好。同时，在信函、备忘录、会议记录或电话记录中可能作出了有关合同履行和质量方面的陈述都应当纳入证据材料中。
同时，在建筑施工纠纷中，通常委托专家进行调查，对缺陷原因进行评估，确定维修费用等。
对工程量和工程造价无法形成最终结算的以及工程是否存在质量问题的纠纷，通常需要委托专业的鉴定机构进行工程造价鉴定和工程质量鉴定。总之，因为建设工程施工纠纷较为复杂，所以大家从合同订立之日起就要树立证据意识和风险意识，搜集和保留与工程有关的所有书面材料。
法律依据：
《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》第十九条
当事人对工程量有争议的，按照施工过程中形成的签证等书面文件确认。承包人能够证明发包人同意其施工，但未能提供签证文件证明工程量发生的，可以按照当事人提供的其他证据确认实际发生的工程量。