针对集体土地的征地纠纷，如果被征收人对征地方案有意见，应当依据《土地管理法》及《土地管理法实施条例》的规定，在经过征地前的告知、听证、征地公告发布及补偿安置方案发布后公告期内及时提出意见，并要求举行听证，如果经过上述程序救济之后，仍对补偿安置方案有异议，应当向县级以上地方人民政府申请协调;协调不成的，由批准征收土地的人民政府裁决。如果裁决后仍不服，可以申请行政复议或行政诉讼。
针对国有土地的征地纠纷，首先征地机关在征求公众意见的时候，被征收人就应当针对有异议的部分充分发表自己的意见，在征地机关作出征收决定发布公告期间，如果对征收决定有异议，可以依法提起行政复议或行政诉讼，如果仍未能达成补偿安置协议，发布征收决定的市、县级人民政府可以依据征收补偿方案向被征收人作出补偿决定，并在房屋征收范围内予以公告，针对上述补偿决定，被征收人仍有权提起行政复议或行政诉讼，被征收人在法定期限内不申请行政复议或者不提起行政诉讼，在补偿决定规定的期限内又不搬迁的，由作出房屋征收决定的市、县级人民政府可以依法申请人民法院强制执行。
法律依据：
《中华人民共和国土地管理法实施条例》第二十五条
征收土地方案经依法批准后，由被征收土地所在地的市、县人民政府组织实施，并将批准征地机关、批准文号、征收土地的用途、范围、面积以及征地补偿标准、农业人员安置办法和办理征地补偿的期限等，在被征收土地所在地的乡(镇)、村予以公告。被征收土地的所有权人、使用权人应当在公告规定的期限内，持土地权属证书到公告指定的人民政府土地行政主管部门办理征地补偿登记。市、县人民政府土地行政主管部门根据经批准的征收土地方案，会同有关部门拟订征地补偿、安置方案，在被征收土地所在地的乡(镇)、村予以公告，听取被征收土地的农村集体经济组织和农民的意见。征地补偿、安置方案报市、县人民政府批准后，由市、县人民政府土地行政主管部门组织实施。对补偿标准有争议的，由县级以上地方人民政府协调;协调不成的，由批准征收土地的人民政府裁决。征地补偿、安置争议不影响征收土地方案的实施。征收土地的各项费用应当自征地补偿、安置方案批准之日起3个月内全额支付。