针对集体土地上的房屋征收，征收单位应当在征得被征收人的意见后将征地相关材料报送省级人民政府或国务院审批，然后履行征地公告及安置补偿方案公告的程序，如果被征收人对安置补偿标准仍然有异议，可以向上级政府申请协调和裁决，但不影响征地的正常实施。如果被征收人始终拒绝签字，又没有提起行政复议或行政诉讼的，征地单位可以责令其交出土地，并申请人民法院依法强制执行。
针对国有土地上的房屋征收，征收机关在征求被征收人意见后应当作出征收决定并发布公告，若被征收人对征收决定不服，可以提起行政复议或行政诉讼，若仍达不成补偿协议，征收机关可以对被征收人作出补偿决定书，被征收人在收到补偿决定书后法定期限内不申请行政复议或不提起行政诉讼，又拒绝搬迁的，征收机关可以向法院申请依法强制执行。
因此，无论是集体土地还是国有土地上房屋征收拆迁项目，只要政府严格依据法律规定履行了征地法定程序，即使最终房主拒绝在安置补偿协议上签字，政府仍然有权利申请人民法院依法强制执行。
法律依据：
《中华人民共和国土地管理法》第八十条
依法收回国有土地使用权当事人拒不交出土地的，临时使用土地期满拒不归还的，或者不按照批准的用途使用国有土地的，由县级以上人民政府土地行政主管部门责令交还土地，处以罚款。
《国有土地上房屋征收与补偿条例》第二十八条
被征收人在法定期限内不申请行政复议或者不提起行政诉讼，在补偿决定规定的期限内又不搬迁的，由作出房屋征收决定的市、县级人民政府依法申请人民法院强制执行。