在对方不配合办理房屋产权的情况下，诉讼程序是相对简单的途径，法院判决后，你可以携带生效判决申请法院强制执行，届时将不再需要对方配合即可办理房屋产权手续。一般诉讼程序3-6个月，并不是很复杂，可以自行处理。
但是对于协议离婚来讲，一旦对方不配合，房屋过户就比较麻烦，因为仅凭离婚证书和离婚协议书，尚不足以证明对方房产过户的真实意思，房屋管理部门无法审查协议的真实性，因此，遇到这种情况，可以采取以下措施：
(一)以不履行离婚协议为由向法院起诉。
如果对方不配合，则是对离婚协议书的不履行，属违约行为，可以向法院起诉，要求对方履行离婚协议书，如果法院判决后对方仍不履行，可以申请法院强制执行，法院可以向房管部门送达协助执行通知书，这样就可以办理过户了。
(二)离婚时，到公证机关办理离婚协议书公证。
为了防止出现离婚后，一方不配合的情况出现，可以在办理离婚时，将离婚协议书公证，以证明协议书的真实性，这样房管局就会对离婚协议书予以认可，将房产过户。准备协议离婚的当事人如果觉得双方协议离婚不够安全时，可以采用公证协议书的办法或者直接向法院起诉，以调解的方式结案，拿到法院的调解书与办理离婚协议书公证一样的效力。
法律依据：
《民事诉讼法》第二百六十七条人民法院对在中华人民共和国领域内没有住所的当事人送达诉讼文书，可以采用下列方式：（一）依照受送达人所在国与中华人民共和国缔结或者共同参加的国际条约中规定的方式送达；（二）通过外交途径送达；（三）对具有中华人民共和国国籍的受送达人，可以委托中华人民共和国驻受送达人所在国的使领馆代为送达；（四）向受送达人委托的有权代其接受送达的诉讼代理人送达；（五）向受送达人在中华人民共和国领域内设立的代表机构或者有权接受送达的分支机构、业务代办人送达；（六）受送达人所在国的法律允许邮寄送达的，可以邮寄送达，自邮寄之日起满三个月，送达回证没有退回，但根据各种情况足以认定已经送达的，期间届满之日视为送达；（七）采用传真、电子邮件等能够确认受送达人收悉的方式送达；（八）不能用上述方式送达的，公告送达，自公告之日起满三个月，即视为送达。
第一百四十四条缺席审判
被告经传票传唤，无正当理由拒不到庭的，或者未经法庭许可中途退庭的，可以缺席判决。