事实婚姻通过协议离婚是否有效

目前我国对事实婚姻是不再进行认定的，但如果是1994年在婚姻登记管理条例发布前，男女符合结婚实质条件的，可以携带相关的证据，如同居关系证明、财产证明等到法院认定事实婚姻，在婚姻登记管理条例发布后的，按同居关系处理，法律上事实婚姻将不受保护。
根据最高人民法院关于适用《中华人民共和国婚姻法》若干问题的解释（一）第五条，未按婚姻法第八条规定办理结婚登记而以夫妻名义共同生活的男女，起诉到人民法院要求离婚的，应当区别对待：
(一)1994年2月1日民政部《婚姻登记管理条例》公布实施以前，男女双方已经符合结婚实质要件的，按事实婚姻处理;
(二)1994年2月1日民政部《婚姻登记管理条例》公布实施以后，男女双方符合结婚实质要件的，人民法院应当告知其在案件受理前补办结婚登记;未补办结婚登记的，按解除同居关系处理。