民法典离婚时双方签订的净身出户协议有效吗

有效。
法院认为一般夫妻之间签订的净身出户的协议只要是在双方自愿的基础上签订的，是双方真实意思表示，且该协议没有违反法律法规的有关规定，那么该协议就是具有法律效力的。
按照《民法典》第一千零六十五条规定：夫妻双方可以约定结婚以前及婚姻关系存续期间所得的财产归属，例如归各自所有、共同所有、部分各自所有、部分共同所有。约定应当采用书面形式。夫妻对婚姻关系存续期间所得的财产以及婚前财产的约定，对双方具有约束力。也就是说夫妻可以约定婚姻关系存续期间所得的财产以及婚前财产归各自所有、共同所有或部分各自所有、部分共同所有。
《民法典》第一千零八十七条，离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理;协议不成的，由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。
对夫或者妻在家庭土地承包经营中享有的权益等，应当依法予以保护。