货物运输合同发生纠纷如何处理

根据《民法典》第八百零九条，货物运输合同发生纠纷处理如下：
1、协商。协商是争议双方在自愿互谅的基础上，按照国家法律政策和合同规定，直接进行磋商，达成协议，以解决合同纠纷的方法，这是一种有效解决纠纷的方法。它有利于迅速平息争议，有利于问题的迅速解决。但是一般纠纷双方往往难以坐下来平心静气的解决问题，并且达成的协商协议只是一种新的合同，并无法律强制性。
2、调解。调解是由第三者主持，合同纠纷的双方当事人参加，通过调解，达成某种协议，解决合同纠纷的方法。调解的程序是：由争议一方向相关部门提出调解申请书及相应的证明材料;相关部门进行审核，符合法律规定即可受理;调解主持人通过与双方交谈，弄清事实，核实证据，分清是非，判明责任，提出调解方案。经过调解，争议双方同意调解人提出的调解方案，由主持调解部门制作调解协议书。
3、仲裁。仲裁是解决民事纠纷的一种较为理想的方式，具有专家裁处、自由、方便、灵活、快捷等特点，而且费用相对低廉。仲裁规则对纠纷双方都具有约束力，而且只要仲裁符合规则，该项仲裁就是终局性的。目前，我国对仲裁进行规范的法律是1995年的《仲裁法》。