分居协议要规定双方的权利和义务，尤其要说明在分居期间，夫妻双方不再有义务与其丈夫或妻子同居。协议中要说明子女由谁抚养，抚养费如何承担以及探望权如何行使?
可以对分居期间的财产进行约定，如无约定或无法达成协议，则仍视为夫妻共同财产。双方若同意，可以在协议中规定分居期间双方不再互相享有家事代理权，如果一方违反则要赔偿另一方的损失；对于一方所负债务，也可约定为一律视为个人债务，一方如果违反要赔偿另一方的损失。
分居的期限，应以三个月至两年为限，期限届满，如一方当事人依然认为感情无法复合而要求离婚的，可协议离婚或持该协议向法院起诉离婚。
关于分居的终止，协议分居可基于当事人双方的协议而终止，但应当制作终止分居的书面协议，以明确此事实。
法律依据：
《民法典》第一千零七十九条 【诉讼离婚】夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解;如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
(一)重婚或者与他人同居;
(二)实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员;
(三)有赌博、吸毒等恶习屡教不改;
(四)因感情不和分居满二年;
(五)其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
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