公司企业与合伙企业大量存在于市场经济体制下，但是公司企业与合伙企业之间的存在着实质上的区别，主要区别如下：
1、设立的基础不同
公司的设立以章程为基础。而合伙的成立则建立在合伙合同的基础上，合伙合同是全体出资人意思表示一致达成的协议。
2、法律地位不同
根据我国《合伙企业法》的规定，合伙企业不具有法人资格。我国《公司法》规定，有限责任公司和股份有限公司是企业法人。
3、内部关系不同
公司有独立、健全的组织机构，这些机构依法律规定对公司的内部及外部事务行使职权。而在合伙企业中，各合伙人对执行合伙企业事务享有同等的权利，可以由全体合伙人共同执行合伙企业的事务，也可以由合伙协议约定或者全体全体合伙人决定，委托一名或者数名合伙人执行合伙企业的事务。
4、企业规模及存续期限不同
公司一般规模较大，存在其间比较长久、稳定，而合伙相对来说则具有短期性，且由人身性强而不可能成为大企业。
5、对债务的承担责任不同
公司股东以出资额为限对公司债务承担有限责任，合伙人对合伙企业债务承担无限连带责任。