一方当事人自行委托有关部门作出的鉴定结论，另一方当事人有证据足以反驳并申请重新鉴定的，人民法院应予准许。由此可以看出，一方当事人自行委托有关部门依法作鉴定，法律并没有禁止，程序不违法。那一方当事人自行委托有关部门做的鉴定结论，什么情况下应当准许重新鉴定的申请呢。必须是申请方有足够的证据足以反驳一方当事人自行委托有关部门做出的鉴定结论，包括程序违法、鉴定人员及机构无资质等问题，否则法院不应准许。
一方当事人自行委托有关部门作鉴定的，一般通过律师事务所进行委托，自己委托的，鉴定机构一般不接受，就算接受，做出来的鉴定也会因程序不合规而成为其他诉讼参与人申请重新鉴定的理由。
法律依据:
《道路交通事故处理工作规范》第五十三条规定 “伤残评定、财产损失评估由当事人自行委托有资格的机构进行评定、评估。公安机关交通管理部门可以向当事人介绍符合条件的评定、评估机构，由当事人自行选择。财产损失数额巨大涉嫌刑事犯罪的，应当由公安机关交通管理部门委托。”
《道路交通事故处理程序规定》第七十一条