取保候审的执行机关是公安机关，所以取保候审的保证金应当由公安机关出具手续后交纳到指定的银行。取保候审的保证金数额由办案机关决定，最低不低于一千。
　　《公安机关办理刑事案件程序规定》（公安部令第127号）第八十三条 犯罪嫌疑人的保证金起点数额为人民币一千元。具体数额应当综合考虑保证诉讼活动正常进行的需要、犯罪嫌疑人的社会危险性、案件的性质、情节、可能判处刑罚的轻重以及犯罪嫌疑人的经济状况等情况确定。
　　《公安机关办理行政案件程序规定》（公安部令第125号）第九十七条 被取保候审人在取保候审期间，没有违反本规定第八十五条、第八十六条有关规定，也没有重新故意犯罪的，或者具有本规定第一百八十三条规定的情形之一的，在解除取保候审、变更强制措施的同时，公安机关应当制作退还保证金决定书，通知银行如数退还保证金。
　　被取保候审人或者其法定代理人可以凭退还保证金决定书到银行领取退还的保证金。
法律依据:
《中华人民共和国刑事诉讼法》第六十七条
《最高人民法院、最高人民检察院、公安部、国家安全部关于取保候审若干问题的规定》
　　1.采取保证金形式取保候审的，保证金的起点数额为一千元。
　　综合考虑犯罪嫌疑人、被告人的社会危险性，案件的情节、性质，可能判处刑罚的轻重，犯罪嫌疑人、被告人经济状况，当地的经济发展水平等情况，确定收取保证金的数额。
　　2、公安部关于取保候审保证金的规定
　保证金的数额，应当根据当地的经济发展水平、犯罪嫌疑人的经济状况以及案件的性质、情节、社会危害性以及可能判处刑罚的轻重等情况，综合考虑确定。
　对经济犯罪、侵犯财产犯罪或者其他造成财产损失的犯罪，可以按涉案数额或者直接财产损失数额的一至三倍确定收取保证金的数额标准；
　对其他刑事犯罪，根据案件的不同情况，保证金的数额标准可以确定在2000元以上50000元以下。