医学出生证明在孩子出生医院办理,在哪儿的医院生的就在哪儿办。凭夫妇双方身份证明等相关材料在分娩医院领取《出生医学证明自填单》，《出生医学证明自填单》由产房大夫认真填写完整。领证人认真、详细检查《出生医学证明自填单》，确认无误签名后即可领取《出生医学证明》。
法律依据:
《出生医学证明管理办法》
第九条 《出生医学证明》的管理和使用单位应建立证件的出、入登记制度，补发和报废登记制度，并建立台账进行管理和备查。各省、自治区、直辖市按照严格管理、方便群众的原则对本省发放程序制定具体规定。

第十条 各级管理和使用单位要妥善运送和保管《出生医学证明》。因意外导致其潮湿、破损或丢失等情况，要及时将其数量及编码逐级上报至省级卫生行政主管部门备案处理。

第十一条 严禁任何单位和个人伪造、倒卖、转让、出借、私自涂改或使用非法印制的《出生医学证明》。
据卫生部、公安部关于《出生医学证明》管理有关规定要求，《出生医学证明》因遗失、被盗等丧失原始凭证的情况要求补发的，应到辖区内妇幼保健机构办理，提出书面申请，并提交如下材料：
（一）持证人父母或其监护人所在单位或村委会等出具的造成《出生医学证明》遗失、被盗的证明材料；
（二）接生单位提供的新生儿出生医学记录及原《出生医学证明》编号的证明；
（三）新生儿父母户口所在地派出所出具的已报或未报户口的证明；
（四）父母双方户口簿及身份证。
经核实情况属实给予补发（已申报出生登记的只补发正页），并加盖市卫生局统一刻制的补发专用章，同时登记备案。