1. 公司发现股东职务侵占后，应及时收集相关证据，如侵占行为的记录、财务账目明细、合同文件等，以证明侵占事实及金额。2. 可与股东协商解决，要求其返还侵占财物并赔偿公司损失。若协商不成，公司可向公安机关报案。公安机关会进行立案侦查，追究其刑事责任。3. 在刑事诉讼过程中，公司可通过刑事附带民事诉讼要求股东返还财物、赔偿损失。若股东的职务侵占行为给公司其他股东造成损失，其他股东也可依法提起民事诉讼要求赔偿。4. 对于职务侵占的股东，公司可依据公司章程规定，对其股东权利进行限制，如限制表决权、利润分配权等，以维护公司及其他股东利益。
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