两个人合伙创业，为了避免日后产生不必要的纠纷，股份的分配方式建议以真实出资比例来确定，如果有股东以非货币方式入股，最好办法是将非货币资源评估作价，以双方协商的作价额入股，如某公司的注册资本为100万元，其中一人以非货币出资作价为20万元，在对方不叠加货币出资的情况下，两人的股权结构应该为20%和80%。
为了平衡二人在业务能力和资源情况上对公司发展的贡献不同，可以通过工资+提成的方式予以弥补，进而平衡两人对公司的贡献与收益的矛盾和利益冲突。
对于如何实现整体控制这个话题，公司法的惯例是以股权比例为界定基础，比如持有67%股权被认定为绝对控股，具有完全话语权的优势，51%被认定为有相对裁决权，34%被认定为决策必需征求人。除非公司章程和合伙协议中另有约定，否则持有公司67%股权，基本上在任何决策上都能达到绝对自主裁决权了。因为标准版章程和公司法上的条款是“重大决策必需征得2/3投票”67%正好高于2/3投票权。
法律依据：
《中华人民共和国公司法》第四十三条
股东会的议事方式和表决程序，除本法有规定的外，由公司章程规定。
股东会会议作出修改公司章程、增加或者减少注册资本的决议，以及公司合并、分立、解散或者变更公司形式的决议，必须经代表三分之二以上表决权的股东通过。