目前，工程垫资在法律上没有禁止，属于有效法律行为。但为避免风险，可以在施工合同中约定甲方应当在工程竣工交付前支付全部或大部分垫资款，否则可以拒绝交付已经完工的工程。同时，可以在施工合同中明确约定垫资款的利息，如果甲方资金较紧张，一般会同意在合同中约定垫资款利息的。另外，也可以在施工合同中约定甲方逾期支付垫资款的，应当向贵公司支付违约金，如果有可能，还可以要求甲方提供垫资担保。
《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》第六条规定：“当事人对垫资和垫资利息有约定，承包人请求按照约定返还垫资及其利息的，应予支持，但是约定的利息计算标准高于中国人民银行发布的同期同类贷款利率的部分除外。当事人对垫资没有约定的，按照工程欠款处理。”
法律依据:
《最高人民法院关于审理建设工程案件施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》第六条
当事人对垫资和垫资利息有约定，承包人请求按照约定返还垫资及其利息的，应予支持，但是约定的利息计算标准高于中国人民银行发布的同期同类贷款利率的部分除外。
当事人对垫资没有约定的，按照工程欠款处理。
当事人对垫资利息没有约定，承包人请求支付利息的，不予支持。