根据《合同法》之规定，依法成立的合同，自成立时生效。法律、行政法规规定应当办理批准、登记等手续生效的，在办理完毕审批、登记手续时生效。附生效条件的合同，自条件成就时生效。附解除条件的合同，自条件成就时失效。因此，合同是否备案，原则上并不影响合同的效力。但是，如果合同的当事人约定了以登记备案为合同生效的条件，那么，就应当自登记备案手续办理之后合同才生效。但我国法律规定，某些合同不备案的，不能产生对抗第三人的公示效力。
例如，商标许可使用合同并不是一定要提交商标局备案，但经过备案的商标许可使用合同能够更好地保护被许可使用人的合法权益。《关于审理商标民事纠纷案件适用法律若干问题的解释》的规定“商标使用许可合同未经备案的，不影响该许可合同的效力，但当事人另有约定的除外。商标使用许可合同未在商标局备案的，不得对抗善意第三人”。
法律依据：
《中华人民共和国合同法》第四十四条
【合同的生效】依法成立的合同，自成立时生效。
法律、行政法规规定应当办理批准、登记等手续生效的，依照其规定。