婚外情、外遇等等是婚姻关系的头号敌人，在法律中，出轨的一方被视作导致婚姻关系破裂的过错方，在财产分割以及其他离婚事项上处于劣势。那么分居后有外遇算不算出轨?
虽然是分居，但是仍属于婚姻存续期间，是属于合法的夫妻，如果和他人恋爱仍算是出轨。
根据《婚姻法》第四条：“夫妻应当互相忠实，互相尊重;家庭成员间应当敬老爱幼，互相帮助，维护平等、和睦、文明的婚姻家庭关系。”的规定，以及结合我国一夫一妻制的基本制度，夫妻关系中只允许拥有一个配偶，分居后有外遇算出轨，因为违背了夫妻之间的忠诚义务。
我国的婚姻实行的是登记制度，也就是说即便夫妻已经分居，但是在法律上依然是夫妻关系。夫妻间的共同财产关系以婚姻关系的存在为基础，婚姻关系解除时，要对共同财产进行分割。对夫妻共同财产进行分割时，一般按照以下原则处理:
　　1、男女平等原则。
　　2、保护妇女、儿童的合法权益原则;
　　3、照顾无过错一方原则;
　　4、尊重当事人意愿原则。对夫妻双方有约定，且约定合法的，按约定处理。约定规避法律或者无效的，按共同财产处理;
　　5、有利生产、方便生活等原则处理。
所以，分居后有外遇导致夫妻关系破裂的一方在财产分割时出于劣势，也就是说会少分或者不分财产。

法律依据：
《中华人民共和国婚姻法》第三十九条
【夫妻共同财产的离婚处理】离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理；协议不成时，由人民法院根据财产的具体情况，照顾子女和女方权益的原则判决。夫或妻在家庭土地承包经营中享有的权益等，应当依法予以保护。