补偿协议一般出现在房屋征迁或者劳动合同关系中。在此我们需要先区分补偿和赔偿的法律概念。补偿带有补充性，赔偿带有惩罚性。所以如获得补偿，其价值一定是比相应的标的的赔偿金额要少。惩罚性是要对行为人的行为做出一定的惩处，补偿只是对行为人给对方造成的损失进行弥补，是不带有惩罚性的。
在明晰了补偿与赔偿的法律关系后，我们在撰写补偿协议内容时一定要完整，不要在内容模糊、关键内容缺失的协议上签字。一般而言，以房屋征迁补偿协议为例，应该包括如下内容：
首先，补偿协议应该对补偿方式进行约定，明确是货币补偿还是产权置换;如果被征收人选择货币补偿的，应该明确货币补偿金额及其支付期限;如果被征收人选择产权调换的，应该明确产权调换房屋的地点、面积，被征收房屋与产权调换房屋的差价结算等内容;
对搬迁费、临时安置费或周转用房进行约定;如果被征收房屋是经营性用房的，还要对停业停产损失补偿作出约定;对搬迁期限、过渡方式、过渡期限等作出约定;对补助与奖励、违约责任以及争议解决方式作出约定;双方认可的其他事项。
法律依据：
《中华人民共和国合同法》第十二条
合同的内容由当事人约定，一般包括以下条款：
(一)当事人的名称或者姓名和住所;
(二)标的;
(三)数量;
(四)质量;
(五)价款或者报酬;
(六)履行期限、地点和方式;
(七)违约责任;
(八)解决争议的方法。
当事人可以参照各类合同的示范文本订立合同。