公司企业与合伙企业大量存在于市场经济体制下，但是公司企业与合伙企业之间的存在着实质上的区别，主要区别如下：
1、设立的基础不同
公司的设立以章程为基础。而合伙的成立则建立在合伙合同的基础上，合伙合同是全体出资人意思表示一致达成的协议。
2、法律地位不同
根据我国《合伙企业法》的规定，合伙企业不具有法人资格。我国《公司法》规定，有限责任公司和股份有限公司是企业法人。
3、内部关系不同
公司有独立、健全的组织机构，这些机构依法律规定对公司的内部及外部事务行使职权。而在合伙企业中，各合伙人对执行合伙企业事务享有同等的权利，可以由全体合伙人共同执行合伙企业的事务，也可以由合伙协议约定或者全体全体合伙人决定，委托一名或者数名合伙人执行合伙企业的事务。
4、企业规模及存续期限不同
公司一般规模较大，存在其间比较长久、稳定，而合伙相对来说则具有短期性，且由人身性强而不可能成为大企业。
5、对债务的承担责任不同
公司股东以出资额为限对公司债务承担有限责任，合伙人对合伙企业债务承担无限连带责任。
法律依据：
《公司法》
第三条公司是企业法人，有独立的法人财产，享有法人财产权。公司以其全部财产对公司的债务承担责任。
有限责任公司的股东以其认缴的出资额为限对公司承担责任;股份有限公司的股东以其认购的股份为限对公司承担责任。
《合伙企业法》
第二条本法所称合伙企业，是指自然人、法人和其他组织依照本法在中国境内设立的普通合伙企业和有限合伙企业。普通合伙企业由普通合伙人组成，合伙人对合伙企业债务承担无限连带责任。本法对普通合伙人承担责任的形式有特别规定的，从其规定。有限合伙企业由普通合伙人和有限合伙人组成，普通合伙人对合伙企业债务承担无限连带责任，有限合伙人以其认缴的出资额为限对合伙企业债务承担责任。