案底是一个人的犯罪记录，也称前科。投案自首是否会留案底，前提是要看投案自首交代的事实是否经过法院依法判决后构成犯罪。如果投案人认为自己的行为构成犯罪，主动自首后，经侦查机关侦查后发现其行为不构成犯罪，不予立案，或检察机关审查以后不构成犯罪而不予起诉，或者审判机关审理以后认为投案人无罪。则投案人就不构成犯罪，不会留案底。相反，如果投案人自首以后，经过侦查机关侦查后认为构成犯罪移交检察院，检察院又起诉至人民法院，人民法院经过审理以后判决投案人有罪，那么投案自首就会留案底。对于犯罪时不满十八周岁，被判处五年有期徒刑以下刑罚的未成年人的犯罪记录，应当予以封存。犯罪记录被封存后，不得向任何单位和个人提供，但司法机关为办案需要或者有关单位根据国家规定进行查询的除外。依法进行查询的单位，应当对被封存的犯罪记录的情况予以保密。
法律依据：
《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百八十六条
犯罪的时候不满十八周岁，被判处五年有期徒刑以下刑罚的，应当对相关犯罪记录予以封存。 犯罪记录被封存的，不得向任何单位和个人提供，但司法机关为办案需要或者有关单位根据国家规定进行查询的除外。依法进行查询的单位，应当对被封存的犯罪记录的情况予以保密。