员工在上下班途中发生交通事故又认定为工伤的，应当按照《道路交通安全法》及工伤保险条例的有关规定处理，受害人在主张交通事故赔偿和工伤保险赔偿方面，要注意以下三个问题。
(一)交通事故赔偿已给付了医疗费、丧葬费、护理费、残疾用具费、误工工资的，企业或者工伤保险经办机构不再支付相应待遇(交通事故赔偿的误工工资相当于工伤部分的停工留薪期间工资)。
(二)交通事故赔偿给付的死亡赔偿金或者残疾赔偿金，与工伤保险的一次性工亡补助金或者一次性伤残补助金并不冲突。受害方可以同时不当道路交通事故赔偿和工伤保险待遇。
(三)企业或者工伤保险经办机构在支付医疗费、丧葬费、护理费、残疾用具费、误工工资等费用后，可以向交通事故责任方追偿。当然，全国对于交通事故赔偿和工伤保险待遇能否同时主张，在各个地方都有不同的判决，当事人要有根据各自地方的实际情况来主张权利。
法律依据：
《道路交通事故处理程序规定》第十三条、第十七条、第十八条、第十九条、第二十一条