合同代签，是否有法律效力要视具体情况而定：
《民法总则》一百六十一条规定，民事主体可以通过代理人实施民事法律行为。依照法律规定、当事人约定或者民事法律行为的性质，应当由本人亲自实施的民事法律行为，不得代理。
第一百七十二条规定，行为人没有代理权、超越代理权或者代理权终止后，仍然实施代理行为，相对人有理由相信行为人有代理权的，代理行为有效。
也就是说：
1、如果是由你的代理人在代理权限内代替你签字的;或你明知他人以你名义在合作协议上签字而不作否认表示，则签字有效，合作协议也有效。
2、如果是他人在无权代理、超越代理权或者代理权终止后的情况下代替你签字的，经你追认后，该代理签字有效，合作协议也就有效。
3、如果不属于上述情形的，则所签合作协议无效，对你没有法律约束力。
法律依据：
《中华人民共和国民法总则》第一百六十一条
民事主体可以通过代理人实施民事法律行为。
依照法律规定、当事人约定或者民事法律行为的性质，应当由本人亲自实施的民事法律行为，不得代理。
《中华人民共和国民法总则》第一百七十二条
行为人没有代理权、超越代理权或者代理权终止后，仍然实施代理行为，相对人有理由相信行为人有代理权的，代理行为有效。