主债务诉讼时效与保证诉讼时效的关系有以下2点：
1、主债务诉讼时效中断的，保证债务诉讼时效不一定中断。形成此种情形的原因主要是，一般保证与连带保证关于诉讼时效中断的规定不同，一般保证中，主债务诉讼时效中断，保证债务诉讼时效中断；连带责任保证中，主债务诉讼时效中断，保证债务诉讼时效不中断。
2、主债务诉讼时效中止的，保证债务的诉讼时效同时中止。
法律依据：
《中华人民共和国民法总则》第一百八十八条
向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护；有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。