公司章程的变更程序大体可以分为以下几个步骤：
第一、提议修改公司章程：一般由董事会提出修改建议。董事会是公司经营的决策机构，对公司经营情况以及章程的执行和变化情况较为了解，能够对公司章程的修改提出具有积极意义的建议;
第二、将修改公司章程的提议通知股东：公司章程修改属于股东(大)会会议审议事项。有限责任公司应当于会议召开十五日前通知全体股东;
第三、股东(大)会决议：一般情况下修改公司章程需要股东(大)会决议。
第四、种类股股东的同意：当公司章程的修改涉及到种类股股东的利益时，我国公司法没有规定章程修改需要经过种类股股东同意这一程序;
第五、特定章程变更事项应经主管机关审批：股东大会决议通过的章程变更事项应经主管机关审批的，需报主管机关批准;
第六、特定章程变更事项的公告：章程变更事项属于法律、法规要求披露的信息，按规定予以公告。
第七、公司章程变更登记：公司章程变更后，公司董事会应向工商行政管理机关申请变更登记。
法律依据：
《中华人民共和国公司法》第四十三条
股东会的议事方式和表决程序，除本法有规定的外，由公司章程规定。
股东会会议作出修改公司章程、增加或者减少注册资本的决议，以及公司合并、分立、解散或者变更公司形式的决议，必须经代表三分之二以上表决权的股东通过。