公司买房与个人买房的所有权有区别，以公司名义买房以后领取的产权证就是单位的名称，以个人买房就是私人所有的房产，单位的房产如果要转让要经董事会股东会作出决议，方可转让，个人的房产转让只要夫妻两同时在买卖契约上签字即可。
公司买房与个人买房的契税不一样，个人144平方米以上3%，144-90平方米1%，90平方米及以下免，单位均为3%，房产登记费80元/件一样的。购房合同备案，主要是预防开发商将一房两卖，保障购房者的合法权益不受侵犯。
如果以个人名义买，在计算个人所得税的应税所得时，不会扣除已经缴纳的房产税。而如果以公司名义买，那么在计算企业所得税时，房产税会从应税所得中扣除。个人和公司买房进行经营都要缴纳房产税，差别不大。最大的差别在于个人买房而用到公司，会有一个营业税和个人所得税的问题，所以最好以公司的名义购房。
法律依据：
《关于调整个人住房转让营业税政策的通知》
一、个人将购买不足2年的住房对外销售的，全额征收营业税；个人将购买2年以上（含2年）的非普通住房对外销售的，按照其销售收入减去购买房屋的价款后的差额征收营业税；个人将购买2年以上（含2年）的普通住房对外销售的，免征营业税。