立案是不会有案底的，有案底从实质上讲就是有前科，刑法规定：未经人民法院判决，对任何人都不得宣告有罪，所以被立案的人不是有前科的人，因为还没有经过审判。
具体的起诉程序如下：公安机关立案侦查，侦查完毕后报请检察院审查起诉，检察院审查后向法院提起公诉，人民法院审判。
双方打架，如果构成轻伤或轻伤以上，打人者就涉嫌故意伤害罪，依法应被追究刑事责任。处三年以下有期徒刑，拘役，管制。如果伤情鉴定为轻微伤，只能要求民事赔偿，受害者可直接向法院起诉要求人身损害赔偿;同时可以要求给予行政处罚。
公安机关立案后，受害者还可以提起刑事附带民事诉讼要求赔偿。当然也可以直接向法院起诉要求人身损害赔偿。人身损害赔偿的项目包括：医疗费、护理费、误工费、住院伙食补助费、营养费、交通费、伤残赔偿金、精神损害抚慰金等。
法律依据：
《中华人民共和国刑法》第二百三十四条
【故意伤害罪】故意伤害他人身体的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制。
犯前款罪，致人重伤的，处三年以上十年以下有期徒刑；致人死亡或者以特别残忍手段致人重伤造成严重残疾的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑。本法另有规定的，依照规定。
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公安机关对打架案件立案后，什么时候会处理是没有规定的，而在实践中一般立案后就会组织警力侦查案件。一般情况下，只有造成轻微伤害及以上伤情的，或者情节较重的，派出所应当立案。
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打架如果造成一方或双方轻伤以上的，就构成故意伤害罪，已经报案就进入司法程序，是不能够撤案的。但受害人可以出具谅解协议，作为法院对犯罪嫌疑人量刑时酌定从轻减轻的情节，但另有规定的除外。
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根据最高人民法院最高人民检察院公安部国家安全部司法部印发的《关于建立犯罪人员犯罪记录制度的意见》的通知规定，案底：是指某人犯罪行为的记录。又称犯罪人员犯罪记录制度，在我国法律中一般指有过刑事...
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